教員データベース - 池田　有理

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（最終更新日：2015-08-24 16:43:26）

  イケダ　ユリ   Mukai-Ikeda Yuri
  池田　有理
   所属   明治大学理工学部

職種専任准教授

■ 著書・論文

1.	2013/09	論文	Discrimination of Xylose O-glycosylation Sites in Mammalian Proteins Chemistry Letters 42(9),pp.1043-1045 （共著）
2.	2013/07	論文	Correlation between Proline-Proline/hydroxy-Proline in collagen proteins and the moisture content of the stratum corneum after oral ingestion International Journal on Applied Bioengineering 7(1),pp.in press （共著）
3.	2013/03	論文	Discrimination of mammalian GPI-anchored proteins by their hydropathy and amino acid propensities Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 77(3),pp.526-533 （共著）
4.	2013	論文	Sugar type discrimination in O-glycosylation based on protein primary sequences Journal of Biomechanical Science and Engineering 8(3),pp.225-232 （共著）
5.	2012/02	論文	Fabrication of langmuir-blodgett films using amphiphilic peptides Journal of Nanoscience and Nanotechnology 12,pp.567-572 （共著）
6.	2012	論文	A computational identification method for GPI-anchored proteins by artificial neural network Current Bioinformatics 7(4),pp.125-131 （共著）
7.	2012	論文	Characteristics of halorhodopsin-bacterioruberin complex from Natronomonas pharaonis membrane in the solubilized system Biochemistry 51,pp.2785-2794 （共著）
8.	2012	論文	oriented α-helical peptides in Langmuir-Blodgett films e-Journal of Surface Science and Nanotechnology 110,pp.379-387 （共著）
9.	2012	論文	pH-dependent interaction between membrane and histidine- containing peptides Chemistry Letters 41(10) （共著）
10.	2012	論文	Structural change and stability of solubilized bacteriorhodopsin International Journal on Applied Bioengineering 6(2),pp.59-65 （共著）
11.	2011/02	論文	Sensitive detection of protein-lipid interaction change on bacteriorhodopsin using dodecyl beta-D-maltoside Biochemistry 50,pp.2283-2290 （共著）
12.	2011/01	論文	Discrimination of golgi type II membrane proteins based on their hydropathy profiles and the amino acid propensities of their transmembrane regions Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 75,pp.82-88 （共著）
13.	2009/07	論文	Identification of GPI-anchored proteins using position specific score matrix FEBS Journal 276(1),pp.126-127 （共著）
14.	2009/03	論文	Development of prediction method for GPCR - G-protein coupling selectivity using amino acid properties The Open Structural Biology Journal 3,pp.149-158 （共著）
15.	2008/01	論文	The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts. Nucleic Acids Research 36,pp.793-799 （共著）
16.	2007/01	論文	Identification of glycosyltransferases focusing on Golgi transmembrane region Trends in Glycoscience and Glycotechnology 19(105),pp.41-47 （共著）
17.	2006/06	論文	バイオインフォマティクスによる糖転移酵素遺伝子の発見ケミカルエンジニヤリング 6(51),437-440頁（共著）
18.	2006/04	論文	A Computational study of structure-reactivity relationships in Na-adduct oligosaccharides in collision-induced dissociation reactions Carbohydrate Research 341(5),pp.624-633 （共著）
19.	2005/11	論文	MIDAS/GPP34, a nuclear gene product, regulates total mitochondrial mass in response to mitochondrial dysfunction Journal of Cell Science 118(22),pp.5357-5367 （共著）
20.	2005/04	論文	Large-scale analysis of human alternative protein isoforms : pattern classification and correlation with subcellular localization signals Nucleic Acids Research 33(8),pp.2355-2363 （共著）
21.	2004/05	著書	The Practical bioinformatician pp.193-216 （共著）
22.	2004/03	論文	A High-throutghput database system for linking ORFs in complete genomes to known protein three-dimensional structures Bioinformatics 20(4),pp.596-598 （共著）
23.	2002/12	論文	GENIUS II: A database system including complete genome ORFs that are assigned to protein three-dimensional domains. Genome Informatics 13,pp.517-518 （共著）
24.	2002/06	論文	Structural stability of bacteriorhodopsin solubilized by Triton X-100 Journal of Photoscience 9(2),pp.293-295 （共著）
25.	1999/09	論文	Effect of detergents on light-induced denaturation of solubilized bacteriorhodopsin Journal of Biosciences 24(68-1) （共著）
26.	1999/09	論文	Light-induced denaturation of bacteriorhodopsin solubilized by detergent Journal of Biosciences 24(68-2) （共著）
27.	1999/09	論文	Light-induced denaturation of bacteriorhodopsin solubilized by octyl-β-glucoside Protein Engineering 12(9),pp.755-759 （共著）
28.	1997/03	論文	Solubilization and denaturation of bacteriorhodopsin by octyl-β-glucoside Reports on Progress of Polymer Physics in Japan 40,pp.531-532 （共著）
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■ 学会発表

1.	2011/09	Correlation between the disaccharide of alkyl glycosides and the structural stability of solubilized membrane protein（The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan）
2.	2011/06/07	ファラオニスハロロドプシンの三量体会合強度に関与するアニオン結合部位の同定（第11回日本蛋白質科学会年会）
3.	2011/06	界面活性剤ドデシルマルトシドを用いた膜タンパク質バクテリオロドプシン-脂質間相互作用変化の敏感な検出（第11回日本蛋白質科学会年会）
4.	2011/06	逆誤差伝播型ニューラルネットワークによるGPIアンカー型タンパク質の判別方法（第11回日本蛋白質科学会年会）
5.	2011/03	両親媒性ペプチドを用いたLB膜の作製と構造評価（第58回　応用物理学会）
6.	2011/03	界面活性剤の分子占有面積と膜タンパク質可溶化能の相関（日本農芸化学会2011年度年会）
7.	2010/12	A discrimination method for golgi type II membrane proteins based on the hydropathy alignment and the position-specific score matrix around their transmembrane regions（2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing）
8.	2010/12	Development a database of genome-wide GPI-anchored proteins（2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing）
9.	2010/12	Discrimination of Golgi type II membrane proteins focusing on thier membrane spanning peptide sequences（5th International Peptide Symposium）
10.	2010/12	Discrimination of GPI-anchored proteins using artificial neural network（5th International Peptide Symposium）
11.	2010/12	Identification of mammalian GPI-anchored proteins based on amino acid propensities in their GPI attachment signal sequences（2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing）
12.	2010/12	Physicochemical properties around N-glycosylation site in mammalian proteins（2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing）
13.	2010/11	Fabrication of Langmuir-Blodgett Films Using Amphiphilic Peptides（the 5th Asian Conference on Nanoscience & Nanotechnology (AsiaNANO2010)）
14.	2010/09	Correlation between tertiary structure and solubility in Dodecyl-beta-D-maltoside on membrane protein bacteriorhodopsin（The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan）
15.	2010/07	Fabrication of Langmuir and Langmuir-Blodgett films using Amphiphilic Peptide（13th International Conference on Organized Molecular Films）
16.	2010/06	Detection of the ligand binding/release state of membrane protein bacteriorhodopsin by the change of solubility in Dodecyl-beta-D-maltoside（35th FEBS Congress）
17.	2010/06	膜タンパク質バクテリオロドプシンのリガンド結合・解離と非イオン性界面活性剤ドデシルマルトシドに対する可溶性の関係（第10回日本蛋白質科学会年会）
18.	2009/11	膜タンパク質の糖鎖修飾解析（先端ナノ・オプト・バイオ材料ワークショップ）
19.	2009/11	膜貫通領域から見た膜タンパク質の特性比較（先端ナノ・オプト・バイオ材料ワークショップ）
20.	2009/07	Computational detection of GPI-anchored proteins using hydropathy profile and PSSM（EUROCARB 2009 (15th European Carbohydrate Symposium)）
21.	2009/07	Identification of GPI-anchored proteins using position specific score matrix（34th FEBS Congress）
22.	2008/11	光駆動アニオンポンプである膜タンパク質ハロロドプシンの大腸菌発現系構築（先端ナノ・オプト・バイオ材料ワークショップ）
23.	2007/11	光受容体膜タンパク質バクテリオロドプシンの可溶化と変性（先端半導体ワークショップ）
24.	2007/06	アミノ酸配列解析によるタンパク質機能予測（第5回現象数理セミナー）
25.	2006/09	膜タンパク質配列－立体構造情報帰属システムの開発（CBRC2006）
26.	2006/02	GGtraP:ゴルジ膜貫通領域に着目した糖転移酵素検出ツール（平成17年度ライフサイエンス分野融合会議）
27.	2006/02	膜タンパク質配列－立体構造情報帰属システムの開発（平成17年度ライフサイエンス分野融合会議）
28.	2005/10	GGtraP : a tool to detect Golgi transmembrane region in glycosyltransferases（CBRC 2005 & ISCBB）
29.	2005/09	GGtraP：糖転移酵素ゴルジ膜貫通領域検出ツール（第4回生命情報科学人材養成コースシンポジウム）
30.	2005/09	膜タンパク質配列－立体構造情報帰属システムの開発（第4回生命情報科学人材養成コースシンポジウム）
31.	2005/03	膜タンパク質構造ドメインデータベースの構築に向けて（第7回ワークショップ微生物ゲノム研究のフロンティア）
32.	2005/02	分子計算による糖鎖断片化解析（平成16年度ライフサイエンス分野融合会議）
33.	2004/10	分子計算による糖鎖構造解析（第3回生命情報科学人材養成コースシンポジウム）
34.	2004/02	GENIUS II: ゲノムに対する蛋白質の立体構造帰属データベースシステム（平成15年度ライフサイエンス分野融合会議）
35.	2004/02	ゴルジ膜局在タンパク質の膜貫通領域予測－糖転移酵素遺伝子　網羅的発見に向けて－（平成15年度ライフサイエンス分野融合会議）
36.	2003/10	ゴルジ膜貫通領域に着目した糖転移酵素の判別（第2回生命情報科学人材養成コースシンポジウム）
37.	2003/10	立体構造帰属データーベースシステム GENIUS II の開発（第2回生命情報科学人材養成コースシンポジウム）
38.	2003/09	立体構造帰属データーベース「GENIUS II」の開発（第41回日本生物物理学会年会）
39.	2003/06	ゴルジ膜貫通領域に着目した糖転移酵素判別手法の開発（第3回日本蛋白質科学会年会）
40.	2003/06	立体構造帰属データーベースシステム「GENIUS II」の開発（第3回日本蛋白質科学会年会）
41.	2003/02	立体構造帰属データーベースシステム GENIUS II の開発（平成14年度ライフサイエンス分野融合会議）
42.	2003/02	糖転移酵素タンパク質のゴルジ膜貫通領域判別手法の開発（平成14年度ライフサイエンス分野融合会議）
43.	2002/12	GENIUS II : a database system including complete genome ORFs that are assigned to protein three-dimensional domains（13th International Conference on Geneme Informatics）
44.	2002/12	核遺伝子産物MIDASによるミトコンドリアの増殖（第2回ミトコンドリア研究会年会）
45.	2002/12	核遺伝子産物MIDASによるミトコンドリアの増殖と分布形態の変化（第25回分子生物学会）
46.	2002/11	Computational detection of golgi membrane spanning region characterized in glycosyltransferase（AIST International Symposium 2002）
47.	2002/11	Triton X-100 による可溶化バクテリオロドプシンの光誘起変性（第40回日本生物物理学会年会）
48.	2002/10	核遺伝子産物MIDASによるミトコンドリア増殖機構（第75回生化学会）
49.	2002/10	糖転移酵素タンパク質のゴルジ膜貫通領域判別アルゴリズムの開発（第1回生命情報科学人材養成コースシンポジウム）
50.	2002/02	原核生物と真核生物オルガネラタンパク質の相関性（平成13年度ライフサイエンス分野融合会議）
51.	2002/01	Triton X-100 により可溶化されたバクテリオロドプシンの構造安定性（第2回高次ゲノム公開ワークショップ）
52.	2001/12	ミトコンドリアDNAの損傷を感知する因子MIDASの細胞内分布（第24回日本分子生物学会年会）
53.	2001/07	Correlation of light-induced denaturation of solubilized bacteriorhodopsin and its structures estimated by circular dichriosim measurements（Abstracts ICBP2001 (4th International Conference on Biological Physics)）
54.	2000/12	MIDAS: ミトコンドリアDNAの損傷を感知する新規因子（第23回日本分子生物学会年会）
55.	2000/12	MIDAS: ミトコンドリアDNAの障害を感知してミトコンドリアDNA複製を促進する新規因子（第23回日本分子生物学会年会）
56.	1999/11	可視領域におけるバクテリオロドプシンのＣＤスペクトルが示す多様性（第6回光生物学協会講演会）
57.	1999/10	バクテリオロドプシン二次元結晶構造と立体構造安定性－オクチルグルコシドによるバクテリオロドプシンの可溶化－（第37回日本生物物理学会年会）
58.	1999/10	可溶化バクテリオロドプシンの光誘起変性に対する中性界面活性剤の効果に関する比較（第37回日本生物物理学会年会）
59.	1999/09	Effect of detergents on light-induced denaturation of solubilized bacteriorhodopsin（13th International Biophysics Congress）
60.	1999/09	Light-induced denaturation of bacteriorhodopsin solubilized by octyl-β-glucoside（13th International Biophysics Congress）
61.	1999/06	バクテリオロドプシンの立体構造安定性における二次元結晶構造の効果Ⅱ.オクチルグルコシド、ドデシルマルトシド、Triton X-100による可溶化の比較（第50回タンパク質構造討論会）
62.	1999/06	バクテリオロドプシン立体構造安定性における二次元結晶構造の効果Ⅰ.オクチルグルコシドで可溶化されたバクテリオロドプシンの光誘起変性実験（第50回タンパク質構造討論会）
63.	1998/12	中性pH条件におけるバクテリオロドプシンＭ中間体の構造安定性（第5回「タンパク質立体構造の構築原理」ワークショップ）
64.	1998/10	バクテリオロドプシンに対する塩酸グアニジンとグリセリンの効果（第36回日本生物物理学会年会）
65.	1998/05	Light-induced denaturation of solubilized bacteriorhodopsin（Retinal Proteins (8th International Conference on Retinal Proteins)）
66.	1998/01	膜タンパク質における立体構造と機能のメカニズム（文部省科学研究費基盤研究（Ａ）報告会）
67.	1997/10	可溶化バクテリオロドプシンの光誘起変性（第35回日本生物物理学会年会）
68.	1996/11	β-オクチルグルコシドによるバクテリオロドプシンの可溶化と変性（第34回日本生物物理学会年会）
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■ 学歴

1.	～2000/03	北海道大学薬学研究科博士課程修了博士（薬学）
2.	1997/03 (学位取得)	東京農工大学工学修士
3.	～1995/03	東京農工大学工学部卒業

■ researchmap研究者コード

5000086853

■ 社会における活動

1.	2013/04～2015/03	バイオインフォマティクス認定試験委員
2.	2008/04～2009/03	電子情報通信学会　ソサイエティ大会実行委員
3.	2007/04～2009/03	バイオインフォマティクス認定試験委員

■ 科研費研究者番号

30371082