シマダ　トモヒロ   SHIMADA TOMOHIRO   島田　友裕    所属   明治大学  農学部    職種   専任准教授
研究期間	2019/04～2022/03
研究課題	大腸菌全シグマ因子の制御標的全プロモーター同定の完成を目指して
実施形態	科学研究費補助金
研究委託元等の名称	日本学術振興会
研究種目名	基盤研究(C)
科研費研究課題番号	19K06618
キーワード	RNAポリメラーゼ, ゲノム転写制御, 大腸菌, Repressive promoter, プロモーター, 窒素欠乏, シグマ因子, Genomic SELEX, シグマ因子RpoN, NtrC, gSELEX, Constitutive promoter, gSELEX法, RpoN
代表分担区分	研究代表者
代表者	島田 友裕
概要	現在までに数万種類を越える微生物のゲノム配列が決定され、１つの生物を構築する遺伝子の全体像が明らかとなってきているが、ゲノムに存在する全遺伝子が利用される仕組みは不明な点が多い。本研究では、１つの生物としてはもっとも遺伝情報が蓄積している大腸菌をモデル生物として、生物が遺伝子を利用する仕組みを分子レベルかつゲノムワイドに理解する事を目指す。ゲノムからの遺伝子発現は、転写装置であるRNAポリメラーゼに７種類あるシグマ因子のいずれかが相互作用してプロモーターを認識することにより行われるため、全シグマ因子の全標的プロモーターを同定する事で、ゲノム転写包括制御機構の全体像の理解を目指す。