ミツタケ　アヨリ   MITSUTAKE AYORI   光武　亜代理    所属   明治大学  理工学部    職種   専任准教授
研究期間	2010/04～2015/03
研究課題	多自由度・大規模系における反応と構造空間探索
実施形態	科学研究費補助金
研究委託元等の名称	日本学術振興会
研究種目名	新学術領域研究(研究領域提案型)
科研費研究課題番号	22104009
キーワード	分子科学, 蛋白質, 計算物理, 分子シミュレーション, 電子状態計算, 生物物理
代表分担区分	研究分担者
代表者	倭 剛久
連携研究者	岡本 祐幸, 足立 伸一
概要	基準振動解析法を用いてリゾチームの圧縮率を計算し、分子進化に伴う圧縮率変化を調べた。また、緩和モード解析を用いてシニョリンの折りたたみ反応の反応座標を抽出した。分子動力学と時間分解X線結晶解析を用いて、ミオグロビンのリガンド移動機構を調べた。そして、COを分子内に配置する平均力ポテンシャルの３Dマップを得た。アミノ酸間の相互作用を解析する新たな手法を開発し、エネルギー交換ネットワークを用いて、アミノ酸間情報伝達を表現した。例として、単ドメインアロステリーを示すPDZ3ドメインの性質を解析した。フラグメント分子軌道法を用いて青色光受容体ファミリー蛋白質の活性部位形成機構を研究した。